Spam Assassin è configurato si default su tutti gli indirizzi e-mail presenti sui server con sistema operativo Unix.

Il filtro è preimpostato con una policy d'intervento lieve (Hits = 7) e può essere modificato dall'utente.

Per intervenire sulla configurazione di Spam Assassin è necessario accedere al pannello di controllo dell'hosting, selezionare il menù mail e selezionare la singola casella di posta su cio si vogliono applicare modifiche.

Selezionando poi il comando Spam Filter ecco le principali opzioni:

Use server personal settings: Per mantenere le opzioni di default impostate sul server (consigliato)
Hits required for spam: E' il livello di filtro, di default 7, più è basso più il livello è elevato. E' consigliabile non scendere al di sotto del 4 per evitare che vengano filtrati messaggi utili.
What to do with email spam: Cosa fare con le mail considerate spam. E' consigliabile selezionare Delete ovvero cancellarle. In altrenativa verranno segnalate come spam ma arriveranno lo stesso.
Black list: E' la lista dei domini da cui non volete ricevere posta. Ad esempio impostando *@sitospam.it, verranno considerate spam tutte le email che arrivano da @sitospam.it
White list: E' la lista dei domini dove non volete applicare il filtro. Ad esempio impostando *@miosito.it, tutte le mail che arriveranno da @miosito.it non verranno filtrate.